基本情况
少年负笈江城桂子山上，周旋魏晋人物诗酒风流之间。偶读美国环境史大家沃斯特《尘暴》一书，始悟史学之中尚有另一天地。故而叩学美国大平原堪萨斯大学，从沃斯特师，一去六年，探究城市与自然关系。归国已近三载，两度春秋消磨清华园中，于2010年受聘人民大学，开始执教生涯，目前为慕尼黑大学卡森中心卡森学者，为期半年。
窃以为环境史家当具真正人文精神，须由人类中心转至生态中心，方可言天人和谐。环境史研究之终极理想当在于历史的批判检验中，寻求今日及未来人与自然关系之平衡。因此上，冀望能为环境史风纪在中国之树立贡献一己之力。
博士论文已修改毕，成书稿：City Natural: Garden and Forest and the Rise of American Environmentalism, 现在匹兹堡大学出版社外审。
当前课题
《山巅之城：波士顿的环境变迁与改革，1803-1901》
 Old Land, New Nature: The Journey of the Ideas and Practices of Nature Conservation from the United States to Modern China
已发表论文、译作
1. 侯深：《远离城市的地方：美国的荒野与19世纪后期的城市绿色改革者》，《新史学》，2011，待发。
2. 侯深：《翡翠都市：19世纪后期波士顿的城市环境改革与美国环境保护意识的兴起》，博士后出站报告，清华大学：历史，2010。
3. 侯深：《<乡村里的推土机>与环境史研究的新视角》，《世界历史》，2010年10月，第5期。
4. 侯深：《前平肖时代的美国森林资源保护思想探析》，《史学月刊》，2009年12月，第12期。
5. 侯深：《自然与都市的融合：波士顿大都市公园体系的建设与启示》，《世界历史》，2009年8月，第4期。
6. 侯深：City Natural: Garden and Forest and the Rise of American Environmentalism （《城市自然化：<园与森林>与美国环境保护主义的兴起》），原博士论文，2008，美国堪萨斯大学：美国史。（此为修改稿书名）
7. 侯深：《中国阅读利奥波德》，《利奥波德通讯》，2007年第1期。“China Reads Leopold,” by Shen Hou, The Leopold Outlook, Volume 7, Issue 1, 2007.
8. 侯深：《死生易同，去就难轻：贾谊人生之再读》，《历史教学问题》，2000年，第5期。
9. 马良怀，侯深：《风流千古，人琴俱存：汉晋之际士人与琴之关系之探讨》， 《华中师范大学学报》（人文社科版），2000年，第3期。
杂文与翻译
1. 夏竹丽：《战天斗地：革命中国的政治与环境》（Judith, Shapiro, Mao’ s War against Nature: Politics and the Environment in Revolutionary China），侯深译：第四章（正文52页，注释10页），将由环境科学出版社出版。
2. 唐纳德·沃斯特：《环境史中的变化》侯深译，《世界历史》，2006年6月，第3期。
3. 唐纳德•沃斯特：《我们为何需要环境史》侯深译，《世界历史》，2004年第3期。
4. 侯深：《自然与城市的冲突与融合——<园与森林>所反映的美国城市环境观念》，《清华历史讲堂》，2011年，待发。
5. 侯深：《寒云路几层：环保运动的根源与发展》，《中国社会科学报》，2010年5月4日。